Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SbdsP70122 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SbdsP70122 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SbdsP70122 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SbdsP70122 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SbdsP70122 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SbdsP70122 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SbdsP70122 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SbdsP70122 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SbdsP70122 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SbdsP70122 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SbdsP70122 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SbdsP70122 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SbdsP70122 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SbdsP70122 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SbdsP70122 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SbdsP70122 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SbdsP70122 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SbdsP70122 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SbdsP70122 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SbdsP70122 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SbdsP70122 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SbdsP70122 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SbdsP70122 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SbdsP70122 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SbdsP70122 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SbdsP70122 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SbdsP70122 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SbdsP70122 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SbdsP70122 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SbdsP70122 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SbdsP70122 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SbdsP70122 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SbdsP70122 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SbdsP70122 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SbdsP70122 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SbdsP70122 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SbdsP70122 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SbdsP70122 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SbdsP70122 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SbdsP70122 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SbdsP70122 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SbdsP70122 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SbdsP70122 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SbdsP70122 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SbdsP70122 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SbdsP70122 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SbdsP70122 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SbdsP70122 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SbdsP70122 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SbdsP70122 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SbdsP70122 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SbdsP70122 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SbdsP70122 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SbdsP70122 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SbdsP70122 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SbdsP70122 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SbdsP70122 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SbdsP70122 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SbdsP70122 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SbdsP70122 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SbdsP70122 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SbdsP70122 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SbdsP70122 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SbdsP70122 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SbdsP70122 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SbdsP70122 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SbdsP70122 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SbdsP70122 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms