Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acta1P68134 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acta1P68134 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Acta1P68134 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acta1P68134 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acta1P68134 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acta1P68134 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acta1P68134 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acta1P68134 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acta1P68134 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acta1P68134 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acta1P68134 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acta1P68134 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acta1P68134 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acta1P68134 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acta1P68134 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acta1P68134 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Acta1P68134 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acta1P68134 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acta1P68134 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Acta1P68134 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acta1P68134 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acta1P68134 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Acta1P68134 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Acta1P68134 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Acta1P68134 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Acta1P68134 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Acta1P68134 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Acta1P68134 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acta1P68134 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acta1P68134 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acta1P68134 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acta1P68134 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Acta1P68134 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Acta1P68134 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acta1P68134 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acta1P68134 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acta1P68134 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acta1P68134 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acta1P68134 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acta1P68134 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acta1P68134 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acta1P68134 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acta1P68134 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Acta1P68134 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Acta1P68134 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Acta1P68134 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Acta1P68134 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Acta1P68134 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms