Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps3P62908 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps3P62908 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps3P62908 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps3P62908 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps3P62908 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps3P62908 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps3P62908 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps3P62908 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps3P62908 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps3P62908 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps3P62908 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps3P62908 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps3P62908 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps3P62908 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps3P62908 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps3P62908 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps3P62908 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps3P62908 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps3P62908 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps3P62908 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps3P62908 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps3P62908 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps3P62908 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps3P62908 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps3P62908 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps3P62908 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps3P62908 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps3P62908 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps3P62908 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps3P62908 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps3P62908 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps3P62908 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps3P62908 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps3P62908 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps3P62908 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps3P62908 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps3P62908 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps3P62908 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps3P62908 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps3P62908 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps3P62908 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps3P62908 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps3P62908 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps3P62908 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps3P62908 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps3P62908 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps3P62908 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps3P62908 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps3P62908 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps3P62908 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps3P62908 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps3P62908 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps3P62908 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps3P62908 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps3P62908 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps3P62908 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps3P62908 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps3P62908 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps3P62908 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps3P62908 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps3P62908 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps3P62908 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps3P62908 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps3P62908 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps3P62908 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps3P62908 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps3P62908 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps3P62908 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps3P62908 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps3P62908 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps3P62908 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps3P62908 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms