Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx1bP61264 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx1bP61264 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx1bP61264 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx1bP61264 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx1bP61264 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx1bP61264 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx1bP61264 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx1bP61264 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx1bP61264 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx1bP61264 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx1bP61264 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx1bP61264 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx1bP61264 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx1bP61264 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx1bP61264 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx1bP61264 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx1bP61264 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx1bP61264 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx1bP61264 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx1bP61264 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stx1bP61264 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx1bP61264 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx1bP61264 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx1bP61264 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx1bP61264 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx1bP61264 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx1bP61264 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx1bP61264 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx1bP61264 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx1bP61264 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx1bP61264 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx1bP61264 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx1bP61264 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx1bP61264 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx1bP61264 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx1bP61264 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx1bP61264 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx1bP61264 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx1bP61264 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx1bP61264 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx1bP61264 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms