Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Wdhd1P59328 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Wdhd1P59328 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Wdhd1P59328 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Wdhd1P59328 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Wdhd1P59328 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Wdhd1P59328 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Wdhd1P59328 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Wdhd1P59328 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Wdhd1P59328 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Wdhd1P59328 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Wdhd1P59328 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Wdhd1P59328 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Wdhd1P59328 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Wdhd1P59328 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Wdhd1P59328 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Wdhd1P59328 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Wdhd1P59328 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Wdhd1P59328 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Wdhd1P59328 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Wdhd1P59328 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Wdhd1P59328 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Wdhd1P59328 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Wdhd1P59328 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Wdhd1P59328 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Wdhd1P59328 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Wdhd1P59328 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Wdhd1P59328 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Wdhd1P59328 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Wdhd1P59328 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Wdhd1P59328 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Wdhd1P59328 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Wdhd1P59328 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Wdhd1P59328 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Wdhd1P59328 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Wdhd1P59328 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Wdhd1P59328 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Wdhd1P59328 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Wdhd1P59328 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Wdhd1P59328 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Wdhd1P59328 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Wdhd1P59328 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Wdhd1P59328 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Wdhd1P59328 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Wdhd1P59328 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Wdhd1P59328 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Wdhd1P59328 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Wdhd1P59328 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Wdhd1P59328 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Wdhd1P59328 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Wdhd1P59328 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Wdhd1P59328 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Wdhd1P59328 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Wdhd1P59328 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Wdhd1P59328 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Wdhd1P59328 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Wdhd1P59328 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Wdhd1P59328 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Wdhd1P59328 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Wdhd1P59328 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Wdhd1P59328 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Wdhd1P59328 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Wdhd1P59328 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Wdhd1P59328 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Wdhd1P59328 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Wdhd1P59328 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Wdhd1P59328 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Wdhd1P59328 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Wdhd1P59328 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Wdhd1P59328 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Wdhd1P59328 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Wdhd1P59328 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Wdhd1P59328 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Wdhd1P59328 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Wdhd1P59328 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Wdhd1P59328 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Wdhd1P59328 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Wdhd1P59328 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Wdhd1P59328 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Wdhd1P59328 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Wdhd1P59328 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Wdhd1P59328 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Wdhd1P59328 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Wdhd1P59328 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Wdhd1P59328 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Wdhd1P59328 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Wdhd1P59328 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Wdhd1P59328 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Wdhd1P59328 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Wdhd1P59328 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Wdhd1P59328 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Wdhd1P59328 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Wdhd1P59328 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Wdhd1P59328 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Wdhd1P59328 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Wdhd1P59328 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Wdhd1P59328 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Wdhd1P59328 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Wdhd1P59328 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Wdhd1P59328 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms