Protein–RNA interactions for Protein: P58929

Gmeb2, Glucocorticoid modulatory element-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gmeb2P58929 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gmeb2P58929 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gmeb2P58929 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gmeb2P58929 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gmeb2P58929 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms