Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctdsp1P58466 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctdsp1P58466 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdsp1P58466 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdsp1P58466 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms