Protein–RNA interactions for Protein: P55849

Dsc1, Desmocollin-1, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc1P55849 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dsc1P55849 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dsc1P55849 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dsc1P55849 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsc1P55849 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsc1P55849 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsc1P55849 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsc1P55849 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dsc1P55849 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Dsc1P55849 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dsc1P55849 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsc1P55849 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsc1P55849 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsc1P55849 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsc1P55849 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsc1P55849 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsc1P55849 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsc1P55849 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsc1P55849 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsc1P55849 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsc1P55849 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsc1P55849 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsc1P55849 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsc1P55849 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsc1P55849 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsc1P55849 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dsc1P55849 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dsc1P55849 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms