Protein–RNA interactions for Protein: P53986

Slc16a1, Monocarboxylate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a1P53986 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc16a1P53986 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc16a1P53986 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc16a1P53986 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc16a1P53986 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc16a1P53986 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc16a1P53986 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc16a1P53986 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc16a1P53986 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc16a1P53986 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc16a1P53986 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc16a1P53986 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc16a1P53986 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc16a1P53986 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc16a1P53986 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc16a1P53986 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc16a1P53986 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc16a1P53986 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc16a1P53986 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc16a1P53986 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc16a1P53986 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc16a1P53986 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc16a1P53986 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc16a1P53986 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc16a1P53986 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc16a1P53986 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.7 ms