Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RabggtbP53612 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RabggtbP53612 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RabggtbP53612 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RabggtbP53612 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RabggtbP53612 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RabggtbP53612 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RabggtbP53612 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RabggtbP53612 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RabggtbP53612 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RabggtbP53612 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RabggtbP53612 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RabggtbP53612 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RabggtbP53612 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RabggtbP53612 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RabggtbP53612 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RabggtbP53612 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RabggtbP53612 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RabggtbP53612 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RabggtbP53612 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RabggtbP53612 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RabggtbP53612 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RabggtbP53612 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RabggtbP53612 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RabggtbP53612 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RabggtbP53612 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RabggtbP53612 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RabggtbP53612 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RabggtbP53612 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RabggtbP53612 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RabggtbP53612 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RabggtbP53612 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RabggtbP53612 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RabggtbP53612 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RabggtbP53612 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RabggtbP53612 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RabggtbP53612 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RabggtbP53612 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RabggtbP53612 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RabggtbP53612 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RabggtbP53612 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RabggtbP53612 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RabggtbP53612 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RabggtbP53612 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RabggtbP53612 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RabggtbP53612 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RabggtbP53612 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RabggtbP53612 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RabggtbP53612 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RabggtbP53612 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RabggtbP53612 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RabggtbP53612 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RabggtbP53612 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RabggtbP53612 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RabggtbP53612 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RabggtbP53612 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RabggtbP53612 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RabggtbP53612 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RabggtbP53612 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RabggtbP53612 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RabggtbP53612 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RabggtbP53612 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RabggtbP53612 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RabggtbP53612 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RabggtbP53612 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RabggtbP53612 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RabggtbP53612 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RabggtbP53612 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RabggtbP53612 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RabggtbP53612 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RabggtbP53612 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RabggtbP53612 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RabggtbP53612 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RabggtbP53612 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RabggtbP53612 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RabggtbP53612 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RabggtbP53612 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RabggtbP53612 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RabggtbP53612 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RabggtbP53612 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RabggtbP53612 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RabggtbP53612 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RabggtbP53612 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RabggtbP53612 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RabggtbP53612 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RabggtbP53612 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RabggtbP53612 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RabggtbP53612 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RabggtbP53612 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RabggtbP53612 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RabggtbP53612 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RabggtbP53612 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RabggtbP53612 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RabggtbP53612 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RabggtbP53612 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RabggtbP53612 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RabggtbP53612 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RabggtbP53612 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RabggtbP53612 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RabggtbP53612 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms