Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp10P52479 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp10P52479 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp10P52479 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp10P52479 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp10P52479 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp10P52479 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp10P52479 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp10P52479 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp10P52479 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp10P52479 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp10P52479 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp10P52479 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp10P52479 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp10P52479 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp10P52479 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp10P52479 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp10P52479 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp10P52479 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp10P52479 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp10P52479 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp10P52479 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp10P52479 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp10P52479 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp10P52479 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp10P52479 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp10P52479 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp10P52479 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp10P52479 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp10P52479 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp10P52479 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp10P52479 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp10P52479 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp10P52479 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp10P52479 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp10P52479 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp10P52479 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp10P52479 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp10P52479 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp10P52479 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp10P52479 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp10P52479 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp10P52479 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp10P52479 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp10P52479 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp10P52479 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp10P52479 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp10P52479 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp10P52479 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp10P52479 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp10P52479 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.5 ms