Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClgnP52194 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClgnP52194 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClgnP52194 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClgnP52194 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClgnP52194 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClgnP52194 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClgnP52194 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClgnP52194 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClgnP52194 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClgnP52194 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClgnP52194 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClgnP52194 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClgnP52194 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClgnP52194 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClgnP52194 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClgnP52194 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClgnP52194 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClgnP52194 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClgnP52194 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClgnP52194 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClgnP52194 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClgnP52194 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ClgnP52194 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClgnP52194 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClgnP52194 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ClgnP52194 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClgnP52194 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ClgnP52194 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClgnP52194 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClgnP52194 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClgnP52194 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClgnP52194 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClgnP52194 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClgnP52194 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClgnP52194 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClgnP52194 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClgnP52194 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClgnP52194 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClgnP52194 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClgnP52194 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClgnP52194 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClgnP52194 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClgnP52194 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ClgnP52194 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClgnP52194 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ClgnP52194 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClgnP52194 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClgnP52194 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClgnP52194 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClgnP52194 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClgnP52194 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClgnP52194 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClgnP52194 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClgnP52194 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClgnP52194 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClgnP52194 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClgnP52194 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ClgnP52194 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ClgnP52194 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ClgnP52194 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ClgnP52194 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ClgnP52194 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ClgnP52194 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ClgnP52194 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ClgnP52194 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ClgnP52194 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ClgnP52194 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClgnP52194 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClgnP52194 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClgnP52194 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClgnP52194 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClgnP52194 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClgnP52194 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClgnP52194 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClgnP52194 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ClgnP52194 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms