Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CntfP51642 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CntfP51642 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CntfP51642 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CntfP51642 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CntfP51642 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CntfP51642 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CntfP51642 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CntfP51642 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CntfP51642 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CntfP51642 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CntfP51642 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CntfP51642 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CntfP51642 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CntfP51642 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CntfP51642 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CntfP51642 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CntfP51642 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CntfP51642 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CntfP51642 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CntfP51642 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CntfP51642 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CntfP51642 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CntfP51642 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CntfP51642 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CntfP51642 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CntfP51642 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CntfP51642 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CntfP51642 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CntfP51642 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CntfP51642 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CntfP51642 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CntfP51642 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CntfP51642 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CntfP51642 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CntfP51642 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CntfP51642 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CntfP51642 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CntfP51642 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CntfP51642 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CntfP51642 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CntfP51642 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CntfP51642 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CntfP51642 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CntfP51642 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CntfP51642 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CntfP51642 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CntfP51642 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CntfP51642 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CntfP51642 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CntfP51642 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CntfP51642 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CntfP51642 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CntfP51642 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CntfP51642 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CntfP51642 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CntfP51642 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CntfP51642 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CntfP51642 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CntfP51642 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CntfP51642 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CntfP51642 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CntfP51642 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CntfP51642 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CntfP51642 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CntfP51642 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CntfP51642 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CntfP51642 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CntfP51642 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CntfP51642 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CntfP51642 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CntfP51642 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CntfP51642 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CntfP51642 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CntfP51642 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CntfP51642 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CntfP51642 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CntfP51642 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CntfP51642 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CntfP51642 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CntfP51642 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CntfP51642 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CntfP51642 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CntfP51642 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CntfP51642 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CntfP51642 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CntfP51642 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CntfP51642 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CntfP51642 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CntfP51642 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CntfP51642 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CntfP51642 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CntfP51642 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CntfP51642 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CntfP51642 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CntfP51642 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CntfP51642 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CntfP51642 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CntfP51642 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CntfP51642 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms