Protein–RNA interactions for Protein: P50714

Defa16, Alpha-defensin 16, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa16P50714 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,81■□□□□ 0,12
Defa16P50714 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15,81■□□□□ 0,12
Defa16P50714 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15,81■□□□□ 0,12
Defa16P50714 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15,81■□□□□ 0,12
Defa16P50714 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,81■□□□□ 0,12
Defa16P50714 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,81■□□□□ 0,12
Defa16P50714 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Defa16P50714 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,8■□□□□ 0,12
Defa16P50714 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15,79■□□□□ 0,12
Defa16P50714 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15,79■□□□□ 0,12
Defa16P50714 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,79■□□□□ 0,12
Defa16P50714 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15,79■□□□□ 0,12
Defa16P50714 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15,79■□□□□ 0,12
Defa16P50714 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,79■□□□□ 0,12
Defa16P50714 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15,79■□□□□ 0,12
Defa16P50714 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,79■□□□□ 0,12
Defa16P50714 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,79■□□□□ 0,12
Defa16P50714 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Defa16P50714 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Defa16P50714 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15,78■□□□□ 0,12
Defa16P50714 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15,78■□□□□ 0,12
Defa16P50714 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Defa16P50714 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,77■□□□□ 0,12
Defa16P50714 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15,77■□□□□ 0,12
Defa16P50714 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15,77■□□□□ 0,12
Defa16P50714 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15,77■□□□□ 0,12
Defa16P50714 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,77■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,77■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15,77■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,77■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,77■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15,76■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15,76■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,76■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,76■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,75■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15,75■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15,75■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15,75■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15,74■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,74■□□□□ 0,11
Defa16P50714 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15,74■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,74■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,74■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15,73■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,73■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,73■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,73■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15,73■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,73■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15,73■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15,73■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15,73■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,73■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15,72■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15,72■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15,72■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,72■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,71■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,71■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,71■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15,71■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15,71■□□□□ 0,11
Defa16P50714 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,71■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,71■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,7■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,7■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15,7■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15,7■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,69■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,69■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15,69■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,69■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,68■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15,68■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,68■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,68■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,68■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15,67■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,67■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,67■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,66■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,66■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15,66■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,66■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,66■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,66■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,66■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,66■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,66■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,66■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,66■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,66■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,66■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,66■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15,66■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,66■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,65■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15,65■□□□□ 0,1
Defa16P50714 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,65■□□□□ 0,1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,4 ms