Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BckdhaP50136 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BckdhaP50136 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BckdhaP50136 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BckdhaP50136 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BckdhaP50136 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BckdhaP50136 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BckdhaP50136 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms