Protein–RNA interactions for Protein: P49698

Hnf4a, Hepatocyte nuclear factor 4-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnf4aP49698 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hnf4aP49698 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hnf4aP49698 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hnf4aP49698 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hnf4aP49698 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hnf4aP49698 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hnf4aP49698 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hnf4aP49698 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hnf4aP49698 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hnf4aP49698 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hnf4aP49698 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hnf4aP49698 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hnf4aP49698 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hnf4aP49698 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hnf4aP49698 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hnf4aP49698 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hnf4aP49698 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hnf4aP49698 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hnf4aP49698 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hnf4aP49698 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hnf4aP49698 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hnf4aP49698 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hnf4aP49698 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hnf4aP49698 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hnf4aP49698 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hnf4aP49698 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hnf4aP49698 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hnf4aP49698 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hnf4aP49698 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hnf4aP49698 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hnf4aP49698 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hnf4aP49698 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hnf4aP49698 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hnf4aP49698 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hnf4aP49698 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms