Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbp3P49194 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbp3P49194 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbp3P49194 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbp3P49194 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbp3P49194 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbp3P49194 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbp3P49194 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbp3P49194 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbp3P49194 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbp3P49194 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rbp3P49194 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rbp3P49194 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rbp3P49194 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rbp3P49194 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rbp3P49194 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbp3P49194 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbp3P49194 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbp3P49194 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbp3P49194 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbp3P49194 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbp3P49194 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbp3P49194 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rbp3P49194 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbp3P49194 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbp3P49194 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbp3P49194 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbp3P49194 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbp3P49194 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbp3P49194 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbp3P49194 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbp3P49194 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbp3P49194 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rbp3P49194 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbp3P49194 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rbp3P49194 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbp3P49194 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbp3P49194 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbp3P49194 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rbp3P49194 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbp3P49194 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbp3P49194 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbp3P49194 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbp3P49194 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbp3P49194 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbp3P49194 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbp3P49194 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rbp3P49194 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rbp3P49194 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rbp3P49194 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rbp3P49194 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rbp3P49194 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbp3P49194 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbp3P49194 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbp3P49194 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbp3P49194 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbp3P49194 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbp3P49194 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbp3P49194 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rbp3P49194 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbp3P49194 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbp3P49194 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbp3P49194 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbp3P49194 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbp3P49194 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbp3P49194 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbp3P49194 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbp3P49194 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbp3P49194 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rbp3P49194 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbp3P49194 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbp3P49194 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rbp3P49194 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbp3P49194 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbp3P49194 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbp3P49194 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbp3P49194 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbp3P49194 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbp3P49194 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbp3P49194 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbp3P49194 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbp3P49194 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbp3P49194 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbp3P49194 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbp3P49194 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbp3P49194 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbp3P49194 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbp3P49194 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbp3P49194 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbp3P49194 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbp3P49194 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbp3P49194 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbp3P49194 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbp3P49194 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbp3P49194 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbp3P49194 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbp3P49194 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbp3P49194 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbp3P49194 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbp3P49194 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms