Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CitP49025 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CitP49025 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CitP49025 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CitP49025 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CitP49025 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CitP49025 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CitP49025 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CitP49025 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CitP49025 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CitP49025 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CitP49025 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CitP49025 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CitP49025 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CitP49025 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CitP49025 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CitP49025 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CitP49025 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CitP49025 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CitP49025 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CitP49025 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CitP49025 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CitP49025 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CitP49025 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CitP49025 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CitP49025 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CitP49025 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CitP49025 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CitP49025 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CitP49025 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CitP49025 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CitP49025 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CitP49025 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CitP49025 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CitP49025 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CitP49025 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CitP49025 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CitP49025 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CitP49025 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CitP49025 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CitP49025 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CitP49025 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CitP49025 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CitP49025 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CitP49025 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CitP49025 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CitP49025 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CitP49025 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CitP49025 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CitP49025 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CitP49025 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CitP49025 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CitP49025 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CitP49025 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CitP49025 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CitP49025 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CitP49025 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CitP49025 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CitP49025 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CitP49025 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CitP49025 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CitP49025 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CitP49025 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CitP49025 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CitP49025 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CitP49025 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CitP49025 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CitP49025 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CitP49025 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CitP49025 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CitP49025 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CitP49025 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CitP49025 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CitP49025 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CitP49025 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CitP49025 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CitP49025 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CitP49025 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CitP49025 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CitP49025 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CitP49025 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CitP49025 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CitP49025 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CitP49025 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CitP49025 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CitP49025 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CitP49025 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CitP49025 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CitP49025 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CitP49025 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CitP49025 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CitP49025 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CitP49025 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CitP49025 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CitP49025 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CitP49025 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CitP49025 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CitP49025 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CitP49025 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CitP49025 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms