Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LmnaP48678 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LmnaP48678 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LmnaP48678 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LmnaP48678 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LmnaP48678 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LmnaP48678 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LmnaP48678 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LmnaP48678 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LmnaP48678 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LmnaP48678 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LmnaP48678 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LmnaP48678 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LmnaP48678 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LmnaP48678 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LmnaP48678 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LmnaP48678 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LmnaP48678 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LmnaP48678 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LmnaP48678 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LmnaP48678 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LmnaP48678 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LmnaP48678 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LmnaP48678 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LmnaP48678 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LmnaP48678 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LmnaP48678 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LmnaP48678 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LmnaP48678 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LmnaP48678 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LmnaP48678 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LmnaP48678 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LmnaP48678 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LmnaP48678 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LmnaP48678 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LmnaP48678 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LmnaP48678 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LmnaP48678 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LmnaP48678 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LmnaP48678 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LmnaP48678 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LmnaP48678 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LmnaP48678 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LmnaP48678 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LmnaP48678 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LmnaP48678 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LmnaP48678 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LmnaP48678 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LmnaP48678 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LmnaP48678 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LmnaP48678 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LmnaP48678 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LmnaP48678 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LmnaP48678 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LmnaP48678 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LmnaP48678 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LmnaP48678 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LmnaP48678 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LmnaP48678 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LmnaP48678 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LmnaP48678 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LmnaP48678 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LmnaP48678 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LmnaP48678 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LmnaP48678 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LmnaP48678 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LmnaP48678 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LmnaP48678 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LmnaP48678 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LmnaP48678 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LmnaP48678 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LmnaP48678 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LmnaP48678 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LmnaP48678 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms