Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SrprbP47758 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SrprbP47758 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SrprbP47758 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SrprbP47758 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SrprbP47758 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SrprbP47758 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SrprbP47758 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SrprbP47758 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SrprbP47758 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SrprbP47758 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SrprbP47758 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SrprbP47758 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SrprbP47758 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SrprbP47758 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SrprbP47758 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SrprbP47758 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SrprbP47758 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SrprbP47758 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SrprbP47758 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SrprbP47758 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SrprbP47758 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SrprbP47758 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SrprbP47758 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SrprbP47758 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SrprbP47758 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SrprbP47758 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SrprbP47758 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SrprbP47758 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SrprbP47758 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SrprbP47758 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SrprbP47758 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SrprbP47758 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SrprbP47758 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SrprbP47758 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SrprbP47758 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SrprbP47758 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SrprbP47758 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SrprbP47758 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SrprbP47758 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SrprbP47758 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SrprbP47758 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SrprbP47758 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SrprbP47758 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SrprbP47758 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SrprbP47758 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SrprbP47758 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SrprbP47758 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SrprbP47758 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SrprbP47758 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SrprbP47758 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SrprbP47758 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SrprbP47758 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SrprbP47758 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SrprbP47758 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SrprbP47758 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SrprbP47758 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SrprbP47758 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SrprbP47758 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SrprbP47758 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SrprbP47758 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SrprbP47758 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SrprbP47758 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SrprbP47758 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SrprbP47758 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SrprbP47758 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SrprbP47758 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SrprbP47758 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SrprbP47758 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SrprbP47758 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SrprbP47758 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SrprbP47758 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SrprbP47758 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SrprbP47758 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SrprbP47758 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SrprbP47758 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SrprbP47758 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SrprbP47758 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SrprbP47758 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SrprbP47758 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SrprbP47758 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SrprbP47758 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SrprbP47758 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SrprbP47758 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SrprbP47758 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SrprbP47758 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SrprbP47758 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SrprbP47758 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SrprbP47758 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SrprbP47758 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SrprbP47758 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SrprbP47758 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SrprbP47758 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SrprbP47758 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SrprbP47758 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SrprbP47758 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SrprbP47758 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SrprbP47758 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SrprbP47758 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SrprbP47758 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms