Protein–RNA interactions for Protein: P47226

Tes, Testin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TesP47226 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TesP47226 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TesP47226 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TesP47226 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TesP47226 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TesP47226 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TesP47226 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TesP47226 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TesP47226 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TesP47226 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TesP47226 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TesP47226 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TesP47226 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TesP47226 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TesP47226 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TesP47226 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TesP47226 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TesP47226 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TesP47226 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TesP47226 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TesP47226 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TesP47226 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TesP47226 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TesP47226 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TesP47226 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TesP47226 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TesP47226 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TesP47226 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TesP47226 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TesP47226 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TesP47226 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TesP47226 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TesP47226 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TesP47226 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TesP47226 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TesP47226 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TesP47226 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TesP47226 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TesP47226 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TesP47226 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TesP47226 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TesP47226 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TesP47226 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TesP47226 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TesP47226 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TesP47226 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TesP47226 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TesP47226 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TesP47226 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TesP47226 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TesP47226 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TesP47226 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TesP47226 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TesP47226 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TesP47226 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TesP47226 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TesP47226 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TesP47226 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TesP47226 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TesP47226 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TesP47226 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TesP47226 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TesP47226 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TesP47226 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TesP47226 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TesP47226 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TesP47226 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TesP47226 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TesP47226 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TesP47226 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TesP47226 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TesP47226 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TesP47226 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TesP47226 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TesP47226 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TesP47226 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TesP47226 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TesP47226 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TesP47226 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TesP47226 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TesP47226 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TesP47226 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TesP47226 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TesP47226 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TesP47226 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TesP47226 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TesP47226 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TesP47226 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TesP47226 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TesP47226 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TesP47226 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TesP47226 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TesP47226 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TesP47226 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TesP47226 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TesP47226 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TesP47226 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TesP47226 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TesP47226 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TesP47226 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms