Protein–RNA interactions for Protein: P46978

Stt3a, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3aP46978 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stt3aP46978 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stt3aP46978 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stt3aP46978 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stt3aP46978 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stt3aP46978 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stt3aP46978 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stt3aP46978 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stt3aP46978 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stt3aP46978 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stt3aP46978 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stt3aP46978 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stt3aP46978 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stt3aP46978 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stt3aP46978 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stt3aP46978 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stt3aP46978 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stt3aP46978 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stt3aP46978 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stt3aP46978 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stt3aP46978 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stt3aP46978 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stt3aP46978 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stt3aP46978 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stt3aP46978 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Stt3aP46978 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stt3aP46978 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stt3aP46978 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stt3aP46978 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stt3aP46978 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stt3aP46978 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stt3aP46978 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Stt3aP46978 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stt3aP46978 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stt3aP46978 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stt3aP46978 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stt3aP46978 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stt3aP46978 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stt3aP46978 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stt3aP46978 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stt3aP46978 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stt3aP46978 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stt3aP46978 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stt3aP46978 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stt3aP46978 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stt3aP46978 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stt3aP46978 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stt3aP46978 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stt3aP46978 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stt3aP46978 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms