Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnfsf4P43488 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnfsf4P43488 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnfsf4P43488 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf4P43488 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf4P43488 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf4P43488 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnfsf4P43488 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfsf4P43488 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfsf4P43488 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfsf4P43488 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnfsf4P43488 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfsf4P43488 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfsf4P43488 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfsf4P43488 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfsf4P43488 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfsf4P43488 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfsf4P43488 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfsf4P43488 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfsf4P43488 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfsf4P43488 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfsf4P43488 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfsf4P43488 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfsf4P43488 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfsf4P43488 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfsf4P43488 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfsf4P43488 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Tnfsf4P43488 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfsf4P43488 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms