Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfsf9P41274 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnfsf9P41274 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfsf9P41274 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfsf9P41274 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfsf9P41274 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnfsf9P41274 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfsf9P41274 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfsf9P41274 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfsf9P41274 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfsf9P41274 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfsf9P41274 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfsf9P41274 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfsf9P41274 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfsf9P41274 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfsf9P41274 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfsf9P41274 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tnfsf9P41274 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfsf9P41274 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfsf9P41274 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfsf9P41274 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfsf9P41274 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfsf9P41274 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfsf9P41274 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfsf9P41274 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfsf9P41274 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfsf9P41274 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfsf9P41274 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfsf9P41274 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfsf9P41274 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfsf9P41274 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfsf9P41274 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfsf9P41274 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfsf9P41274 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnfsf9P41274 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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