Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl28P41105 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl28P41105 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl28P41105 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl28P41105 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl28P41105 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl28P41105 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl28P41105 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl28P41105 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl28P41105 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl28P41105 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl28P41105 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl28P41105 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl28P41105 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl28P41105 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl28P41105 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl28P41105 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl28P41105 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl28P41105 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl28P41105 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl28P41105 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl28P41105 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl28P41105 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl28P41105 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl28P41105 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl28P41105 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl28P41105 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl28P41105 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl28P41105 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl28P41105 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl28P41105 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl28P41105 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl28P41105 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpl28P41105 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl28P41105 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl28P41105 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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