Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Csf3rP40223 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csf3rP40223 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csf3rP40223 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Csf3rP40223 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms