Protein–RNA interactions for Protein: P35846

Folr1, Folate receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Folr1P35846 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Folr1P35846 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Folr1P35846 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Folr1P35846 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Folr1P35846 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Folr1P35846 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Folr1P35846 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Folr1P35846 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Folr1P35846 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Folr1P35846 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Folr1P35846 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Folr1P35846 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Folr1P35846 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Folr1P35846 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Folr1P35846 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Folr1P35846 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Folr1P35846 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Folr1P35846 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Folr1P35846 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Folr1P35846 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Folr1P35846 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Folr1P35846 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Folr1P35846 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Folr1P35846 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Folr1P35846 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Folr1P35846 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Folr1P35846 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Folr1P35846 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Folr1P35846 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Folr1P35846 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Folr1P35846 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Folr1P35846 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Folr1P35846 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Folr1P35846 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Folr1P35846 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Folr1P35846 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Folr1P35846 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Folr1P35846 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Folr1P35846 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Folr1P35846 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Folr1P35846 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Folr1P35846 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Folr1P35846 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Folr1P35846 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Folr1P35846 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Folr1P35846 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Folr1P35846 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Folr1P35846 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Folr1P35846 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Folr1P35846 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Folr1P35846 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Folr1P35846 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Folr1P35846 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Folr1P35846 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Folr1P35846 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Folr1P35846 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Folr1P35846 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Folr1P35846 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Folr1P35846 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Folr1P35846 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Folr1P35846 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Folr1P35846 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Folr1P35846 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Folr1P35846 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Folr1P35846 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Folr1P35846 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Folr1P35846 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Folr1P35846 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Folr1P35846 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Folr1P35846 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Folr1P35846 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Folr1P35846 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Folr1P35846 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Folr1P35846 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Folr1P35846 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Folr1P35846 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Folr1P35846 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Folr1P35846 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Folr1P35846 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Folr1P35846 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Folr1P35846 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Folr1P35846 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Folr1P35846 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Folr1P35846 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Folr1P35846 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Folr1P35846 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Folr1P35846 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Folr1P35846 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Folr1P35846 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Folr1P35846 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Folr1P35846 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Folr1P35846 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Folr1P35846 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Folr1P35846 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Folr1P35846 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Folr1P35846 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Folr1P35846 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Folr1P35846 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Folr1P35846 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Folr1P35846 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms