Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ddit3P35639 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ddit3P35639 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ddit3P35639 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ddit3P35639 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ddit3P35639 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ddit3P35639 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ddit3P35639 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ddit3P35639 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ddit3P35639 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ddit3P35639 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ddit3P35639 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ddit3P35639 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddit3P35639 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddit3P35639 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddit3P35639 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ddit3P35639 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ddit3P35639 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ddit3P35639 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ddit3P35639 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ddit3P35639 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ddit3P35639 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ddit3P35639 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ddit3P35639 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ddit3P35639 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ddit3P35639 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ddit3P35639 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ddit3P35639 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ddit3P35639 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ddit3P35639 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ddit3P35639 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ddit3P35639 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ddit3P35639 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ddit3P35639 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ddit3P35639 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ddit3P35639 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ddit3P35639 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ddit3P35639 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ddit3P35639 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ddit3P35639 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ddit3P35639 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ddit3P35639 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ddit3P35639 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ddit3P35639 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ddit3P35639 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ddit3P35639 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ddit3P35639 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ddit3P35639 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ddit3P35639 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ddit3P35639 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ddit3P35639 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ddit3P35639 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ddit3P35639 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ddit3P35639 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ddit3P35639 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ddit3P35639 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ddit3P35639 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ddit3P35639 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ddit3P35639 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ddit3P35639 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ddit3P35639 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ddit3P35639 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ddit3P35639 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ddit3P35639 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ddit3P35639 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ddit3P35639 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ddit3P35639 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ddit3P35639 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ddit3P35639 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ddit3P35639 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms