Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rfc1P35601 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rfc1P35601 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rfc1P35601 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfc1P35601 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfc1P35601 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfc1P35601 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfc1P35601 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfc1P35601 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfc1P35601 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfc1P35601 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfc1P35601 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfc1P35601 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfc1P35601 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfc1P35601 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfc1P35601 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfc1P35601 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rfc1P35601 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rfc1P35601 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rfc1P35601 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rfc1P35601 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rfc1P35601 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rfc1P35601 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfc1P35601 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfc1P35601 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfc1P35601 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfc1P35601 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rfc1P35601 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms