Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mmp12P34960 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp12P34960 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mmp12P34960 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp12P34960 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp12P34960 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp12P34960 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp12P34960 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp12P34960 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp12P34960 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp12P34960 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp12P34960 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp12P34960 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp12P34960 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp12P34960 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp12P34960 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp12P34960 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp12P34960 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp12P34960 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp12P34960 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp12P34960 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp12P34960 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp12P34960 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp12P34960 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp12P34960 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp12P34960 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp12P34960 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp12P34960 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp12P34960 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms