Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apoc1P34928 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apoc1P34928 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoc1P34928 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms