Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Saa4P31532 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Saa4P31532 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Saa4P31532 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Saa4P31532 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Saa4P31532 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Saa4P31532 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Saa4P31532 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Saa4P31532 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Saa4P31532 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Saa4P31532 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Saa4P31532 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms