Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pabpc1P29341 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pabpc1P29341 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc1P29341 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc1P29341 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc1P29341 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pabpc1P29341 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pabpc1P29341 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pabpc1P29341 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pabpc1P29341 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pabpc1P29341 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pabpc1P29341 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pabpc1P29341 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pabpc1P29341 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc1P29341 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc1P29341 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pabpc1P29341 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc1P29341 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc1P29341 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc1P29341 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc1P29341 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pabpc1P29341 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc1P29341 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc1P29341 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc1P29341 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pabpc1P29341 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc1P29341 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pabpc1P29341 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpc1P29341 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpc1P29341 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pabpc1P29341 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pabpc1P29341 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pabpc1P29341 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms