Protein–RNA interactions for Protein: P28825

Mep1a, Meprin A subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mep1aP28825 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mep1aP28825 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mep1aP28825 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mep1aP28825 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mep1aP28825 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mep1aP28825 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mep1aP28825 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mep1aP28825 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mep1aP28825 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mep1aP28825 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mep1aP28825 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mep1aP28825 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mep1aP28825 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mep1aP28825 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Mep1aP28825 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mep1aP28825 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mep1aP28825 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Mep1aP28825 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mep1aP28825 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mep1aP28825 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mep1aP28825 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mep1aP28825 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mep1aP28825 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mep1aP28825 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mep1aP28825 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms