Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atxn10P28658 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atxn10P28658 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atxn10P28658 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atxn10P28658 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atxn10P28658 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atxn10P28658 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atxn10P28658 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn10P28658 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atxn10P28658 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atxn10P28658 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atxn10P28658 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atxn10P28658 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atxn10P28658 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atxn10P28658 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atxn10P28658 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atxn10P28658 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atxn10P28658 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atxn10P28658 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atxn10P28658 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atxn10P28658 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Atxn10P28658 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atxn10P28658 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atxn10P28658 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atxn10P28658 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn10P28658 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn10P28658 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn10P28658 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn10P28658 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn10P28658 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn10P28658 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn10P28658 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn10P28658 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn10P28658 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn10P28658 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn10P28658 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn10P28658 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn10P28658 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn10P28658 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn10P28658 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn10P28658 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn10P28658 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn10P28658 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn10P28658 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn10P28658 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn10P28658 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn10P28658 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms