Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PdgfraP26618 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PdgfraP26618 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PdgfraP26618 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PdgfraP26618 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PdgfraP26618 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PdgfraP26618 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PdgfraP26618 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PdgfraP26618 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PdgfraP26618 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PdgfraP26618 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PdgfraP26618 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PdgfraP26618 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PdgfraP26618 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PdgfraP26618 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PdgfraP26618 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PdgfraP26618 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PdgfraP26618 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PdgfraP26618 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PdgfraP26618 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PdgfraP26618 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PdgfraP26618 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PdgfraP26618 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PdgfraP26618 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PdgfraP26618 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PdgfraP26618 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PdgfraP26618 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PdgfraP26618 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PdgfraP26618 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PdgfraP26618 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PdgfraP26618 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PdgfraP26618 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PdgfraP26618 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PdgfraP26618 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PdgfraP26618 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PdgfraP26618 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PdgfraP26618 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PdgfraP26618 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdgfraP26618 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PdgfraP26618 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PdgfraP26618 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PdgfraP26618 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PdgfraP26618 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PdgfraP26618 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PdgfraP26618 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PdgfraP26618 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PdgfraP26618 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PdgfraP26618 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PdgfraP26618 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms