Protein–RNA interactions for Protein: P23950

Zfp36l1, mRNA decay activator protein ZFP36L1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36l1P23950 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp36l1P23950 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zfp36l1P23950 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zfp36l1P23950 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp36l1P23950 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp36l1P23950 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp36l1P23950 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp36l1P23950 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp36l1P23950 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp36l1P23950 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp36l1P23950 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp36l1P23950 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp36l1P23950 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp36l1P23950 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp36l1P23950 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp36l1P23950 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp36l1P23950 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp36l1P23950 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp36l1P23950 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp36l1P23950 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp36l1P23950 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp36l1P23950 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp36l1P23950 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp36l1P23950 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp36l1P23950 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp36l1P23950 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp36l1P23950 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp36l1P23950 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp36l1P23950 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp36l1P23950 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp36l1P23950 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp36l1P23950 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp36l1P23950 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp36l1P23950 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp36l1P23950 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms