Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb9P20615 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxb9P20615 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxb9P20615 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxb9P20615 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxb9P20615 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxb9P20615 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxb9P20615 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxb9P20615 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxb9P20615 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxb9P20615 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxb9P20615 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxb9P20615 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb9P20615 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb9P20615 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb9P20615 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb9P20615 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb9P20615 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb9P20615 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb9P20615 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxb9P20615 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxb9P20615 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxb9P20615 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb9P20615 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb9P20615 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb9P20615 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb9P20615 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb9P20615 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb9P20615 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb9P20615 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb9P20615 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb9P20615 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb9P20615 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb9P20615 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb9P20615 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb9P20615 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb9P20615 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxb9P20615 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hoxb9P20615 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb9P20615 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb9P20615 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb9P20615 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb9P20615 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb9P20615 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb9P20615 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb9P20615 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb9P20615 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb9P20615 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb9P20615 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb9P20615 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb9P20615 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxb9P20615 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxb9P20615 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.9 ms