Protein–RNA interactions for Protein: P18165

Lor, Loricrin, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LorP18165 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
LorP18165 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
LorP18165 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LorP18165 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LorP18165 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LorP18165 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
LorP18165 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
LorP18165 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LorP18165 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LorP18165 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
LorP18165 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LorP18165 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LorP18165 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LorP18165 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LorP18165 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LorP18165 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LorP18165 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LorP18165 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LorP18165 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LorP18165 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LorP18165 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LorP18165 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LorP18165 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LorP18165 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LorP18165 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LorP18165 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LorP18165 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LorP18165 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LorP18165 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LorP18165 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LorP18165 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LorP18165 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LorP18165 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LorP18165 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LorP18165 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LorP18165 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LorP18165 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LorP18165 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LorP18165 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LorP18165 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LorP18165 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LorP18165 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LorP18165 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LorP18165 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LorP18165 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LorP18165 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
LorP18165 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LorP18165 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LorP18165 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LorP18165 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LorP18165 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LorP18165 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LorP18165 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LorP18165 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LorP18165 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LorP18165 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LorP18165 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LorP18165 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LorP18165 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LorP18165 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LorP18165 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LorP18165 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LorP18165 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LorP18165 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LorP18165 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LorP18165 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LorP18165 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LorP18165 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LorP18165 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LorP18165 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LorP18165 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LorP18165 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LorP18165 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LorP18165 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LorP18165 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LorP18165 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LorP18165 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LorP18165 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LorP18165 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LorP18165 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LorP18165 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LorP18165 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LorP18165 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LorP18165 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LorP18165 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LorP18165 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LorP18165 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LorP18165 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LorP18165 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LorP18165 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LorP18165 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LorP18165 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LorP18165 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LorP18165 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LorP18165 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LorP18165 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LorP18165 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LorP18165 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LorP18165 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LorP18165 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms