Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SptbP15508 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SptbP15508 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SptbP15508 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SptbP15508 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SptbP15508 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SptbP15508 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SptbP15508 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SptbP15508 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SptbP15508 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SptbP15508 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SptbP15508 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SptbP15508 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SptbP15508 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SptbP15508 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SptbP15508 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SptbP15508 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SptbP15508 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SptbP15508 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SptbP15508 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SptbP15508 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SptbP15508 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SptbP15508 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SptbP15508 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SptbP15508 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SptbP15508 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SptbP15508 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SptbP15508 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SptbP15508 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SptbP15508 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SptbP15508 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SptbP15508 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SptbP15508 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SptbP15508 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SptbP15508 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SptbP15508 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SptbP15508 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SptbP15508 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SptbP15508 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SptbP15508 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SptbP15508 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SptbP15508 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SptbP15508 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SptbP15508 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SptbP15508 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SptbP15508 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SptbP15508 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SptbP15508 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SptbP15508 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SptbP15508 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SptbP15508 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SptbP15508 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SptbP15508 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SptbP15508 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SptbP15508 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SptbP15508 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SptbP15508 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SptbP15508 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SptbP15508 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SptbP15508 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SptbP15508 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SptbP15508 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SptbP15508 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SptbP15508 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SptbP15508 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SptbP15508 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SptbP15508 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SptbP15508 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SptbP15508 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SptbP15508 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SptbP15508 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SptbP15508 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SptbP15508 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SptbP15508 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SptbP15508 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SptbP15508 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SptbP15508 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SptbP15508 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SptbP15508 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SptbP15508 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SptbP15508 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SptbP15508 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SptbP15508 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SptbP15508 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SptbP15508 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SptbP15508 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SptbP15508 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SptbP15508 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SptbP15508 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SptbP15508 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SptbP15508 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SptbP15508 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SptbP15508 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SptbP15508 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SptbP15508 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SptbP15508 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SptbP15508 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SptbP15508 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SptbP15508 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SptbP15508 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.3 ms