Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd44P15379 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd44P15379 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd44P15379 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd44P15379 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd44P15379 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd44P15379 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd44P15379 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd44P15379 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd44P15379 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd44P15379 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd44P15379 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd44P15379 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd44P15379 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd44P15379 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd44P15379 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd44P15379 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd44P15379 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd44P15379 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd44P15379 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cd44P15379 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd44P15379 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd44P15379 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd44P15379 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd44P15379 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd44P15379 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd44P15379 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd44P15379 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd44P15379 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd44P15379 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd44P15379 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd44P15379 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd44P15379 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd44P15379 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd44P15379 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd44P15379 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd44P15379 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd44P15379 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd44P15379 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd44P15379 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd44P15379 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd44P15379 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd44P15379 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd44P15379 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd44P15379 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd44P15379 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd44P15379 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd44P15379 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd44P15379 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd44P15379 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd44P15379 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd44P15379 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd44P15379 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd44P15379 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd44P15379 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd44P15379 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd44P15379 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd44P15379 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd44P15379 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd44P15379 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd44P15379 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd44P15379 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd44P15379 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd44P15379 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd44P15379 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd44P15379 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd44P15379 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd44P15379 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd44P15379 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cd44P15379 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cd44P15379 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cd44P15379 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cd44P15379 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd44P15379 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd44P15379 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd44P15379 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd44P15379 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd44P15379 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd44P15379 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd44P15379 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd44P15379 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd44P15379 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd44P15379 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd44P15379 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd44P15379 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd44P15379 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd44P15379 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms