Protein–RNA interactions for Protein: P15209

Ntrk2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntrk2P15209 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ntrk2P15209 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ntrk2P15209 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ntrk2P15209 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ntrk2P15209 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ntrk2P15209 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ntrk2P15209 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ntrk2P15209 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ntrk2P15209 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ntrk2P15209 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ntrk2P15209 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ntrk2P15209 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ntrk2P15209 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ntrk2P15209 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ntrk2P15209 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ntrk2P15209 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ntrk2P15209 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ntrk2P15209 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ntrk2P15209 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ntrk2P15209 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ntrk2P15209 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ntrk2P15209 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ntrk2P15209 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ntrk2P15209 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ntrk2P15209 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ntrk2P15209 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ntrk2P15209 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ntrk2P15209 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ntrk2P15209 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ntrk2P15209 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ntrk2P15209 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ntrk2P15209 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ntrk2P15209 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ntrk2P15209 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ntrk2P15209 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ntrk2P15209 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ntrk2P15209 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ntrk2P15209 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ntrk2P15209 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ntrk2P15209 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms