Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmnb1P14733 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lmnb1P14733 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lmnb1P14733 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lmnb1P14733 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lmnb1P14733 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lmnb1P14733 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lmnb1P14733 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lmnb1P14733 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Lmnb1P14733 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lmnb1P14733 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lmnb1P14733 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lmnb1P14733 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Lmnb1P14733 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmnb1P14733 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmnb1P14733 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmnb1P14733 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmnb1P14733 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmnb1P14733 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmnb1P14733 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmnb1P14733 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lmnb1P14733 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmnb1P14733 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmnb1P14733 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmnb1P14733 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmnb1P14733 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmnb1P14733 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmnb1P14733 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmnb1P14733 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmnb1P14733 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmnb1P14733 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmnb1P14733 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmnb1P14733 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmnb1P14733 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmnb1P14733 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmnb1P14733 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmnb1P14733 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lmnb1P14733 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmnb1P14733 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmnb1P14733 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmnb1P14733 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmnb1P14733 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmnb1P14733 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmnb1P14733 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmnb1P14733 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmnb1P14733 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmnb1P14733 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmnb1P14733 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmnb1P14733 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmnb1P14733 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmnb1P14733 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmnb1P14733 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmnb1P14733 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmnb1P14733 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmnb1P14733 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmnb1P14733 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmnb1P14733 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmnb1P14733 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmnb1P14733 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmnb1P14733 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmnb1P14733 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmnb1P14733 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lmnb1P14733 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmnb1P14733 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmnb1P14733 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmnb1P14733 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmnb1P14733 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lmnb1P14733 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmnb1P14733 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmnb1P14733 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lmnb1P14733 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lmnb1P14733 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lmnb1P14733 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmnb1P14733 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmnb1P14733 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lmnb1P14733 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Lmnb1P14733 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Lmnb1P14733 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lmnb1P14733 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lmnb1P14733 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lmnb1P14733 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lmnb1P14733 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lmnb1P14733 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lmnb1P14733 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lmnb1P14733 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lmnb1P14733 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lmnb1P14733 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lmnb1P14733 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lmnb1P14733 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lmnb1P14733 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lmnb1P14733 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lmnb1P14733 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lmnb1P14733 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lmnb1P14733 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Lmnb1P14733 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lmnb1P14733 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Lmnb1P14733 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lmnb1P14733 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lmnb1P14733 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lmnb1P14733 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.5 ms