Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vpreb2P13373 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vpreb2P13373 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vpreb2P13373 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vpreb2P13373 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms