Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nr4a1P12813 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nr4a1P12813 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nr4a1P12813 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nr4a1P12813 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nr4a1P12813 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nr4a1P12813 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nr4a1P12813 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nr4a1P12813 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nr4a1P12813 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nr4a1P12813 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nr4a1P12813 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nr4a1P12813 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nr4a1P12813 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nr4a1P12813 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Nr4a1P12813 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Nr4a1P12813 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nr4a1P12813 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nr4a1P12813 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nr4a1P12813 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Nr4a1P12813 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nr4a1P12813 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nr4a1P12813 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nr4a1P12813 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nr4a1P12813 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms