Protein–RNA interactions for Protein: P12672

Rapsn, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RapsnP12672 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RapsnP12672 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RapsnP12672 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RapsnP12672 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RapsnP12672 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RapsnP12672 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RapsnP12672 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RapsnP12672 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RapsnP12672 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RapsnP12672 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RapsnP12672 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RapsnP12672 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RapsnP12672 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RapsnP12672 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RapsnP12672 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RapsnP12672 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RapsnP12672 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RapsnP12672 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RapsnP12672 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RapsnP12672 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RapsnP12672 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RapsnP12672 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RapsnP12672 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RapsnP12672 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RapsnP12672 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RapsnP12672 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RapsnP12672 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RapsnP12672 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RapsnP12672 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RapsnP12672 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RapsnP12672 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RapsnP12672 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RapsnP12672 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RapsnP12672 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RapsnP12672 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RapsnP12672 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RapsnP12672 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RapsnP12672 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RapsnP12672 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms