Protein–RNA interactions for Protein: P12023

App, Amyloid-beta A4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AppP12023 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AppP12023 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AppP12023 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AppP12023 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AppP12023 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AppP12023 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
AppP12023 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
AppP12023 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AppP12023 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AppP12023 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
AppP12023 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
AppP12023 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AppP12023 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
AppP12023 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AppP12023 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AppP12023 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AppP12023 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AppP12023 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AppP12023 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AppP12023 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AppP12023 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AppP12023 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AppP12023 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AppP12023 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AppP12023 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AppP12023 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AppP12023 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AppP12023 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AppP12023 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AppP12023 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AppP12023 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AppP12023 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AppP12023 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AppP12023 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AppP12023 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AppP12023 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
AppP12023 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AppP12023 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AppP12023 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AppP12023 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AppP12023 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AppP12023 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AppP12023 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AppP12023 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AppP12023 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AppP12023 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AppP12023 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AppP12023 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AppP12023 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AppP12023 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
AppP12023 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AppP12023 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AppP12023 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AppP12023 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AppP12023 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AppP12023 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AppP12023 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AppP12023 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AppP12023 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AppP12023 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AppP12023 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AppP12023 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AppP12023 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AppP12023 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AppP12023 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AppP12023 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AppP12023 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AppP12023 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AppP12023 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AppP12023 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AppP12023 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
AppP12023 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
AppP12023 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AppP12023 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
AppP12023 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AppP12023 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AppP12023 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AppP12023 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AppP12023 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AppP12023 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AppP12023 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
AppP12023 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AppP12023 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
AppP12023 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
AppP12023 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AppP12023 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
AppP12023 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AppP12023 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AppP12023 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
AppP12023 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AppP12023 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AppP12023 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AppP12023 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AppP12023 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AppP12023 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AppP12023 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AppP12023 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AppP12023 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AppP12023 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AppP12023 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms