Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spp1P10923 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spp1P10923 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spp1P10923 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spp1P10923 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Spp1P10923 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Spp1P10923 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spp1P10923 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spp1P10923 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spp1P10923 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spp1P10923 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spp1P10923 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spp1P10923 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Spp1P10923 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spp1P10923 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spp1P10923 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Spp1P10923 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spp1P10923 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spp1P10923 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spp1P10923 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spp1P10923 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spp1P10923 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spp1P10923 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Spp1P10923 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spp1P10923 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spp1P10923 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spp1P10923 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spp1P10923 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spp1P10923 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spp1P10923 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spp1P10923 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spp1P10923 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spp1P10923 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spp1P10923 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Spp1P10923 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spp1P10923 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spp1P10923 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spp1P10923 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spp1P10923 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spp1P10923 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spp1P10923 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spp1P10923 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spp1P10923 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spp1P10923 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spp1P10923 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spp1P10923 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spp1P10923 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spp1P10923 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Spp1P10923 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Spp1P10923 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spp1P10923 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spp1P10923 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spp1P10923 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spp1P10923 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spp1P10923 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spp1P10923 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Spp1P10923 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Spp1P10923 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spp1P10923 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spp1P10923 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spp1P10923 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spp1P10923 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spp1P10923 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spp1P10923 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spp1P10923 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spp1P10923 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spp1P10923 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Spp1P10923 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Spp1P10923 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spp1P10923 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spp1P10923 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spp1P10923 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spp1P10923 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms