Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
UbbP0CG49 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UbbP0CG49 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UbbP0CG49 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UbbP0CG49 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UbbP0CG49 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UbbP0CG49 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UbbP0CG49 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UbbP0CG49 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UbbP0CG49 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UbbP0CG49 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UbbP0CG49 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UbbP0CG49 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UbbP0CG49 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UbbP0CG49 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UbbP0CG49 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UbbP0CG49 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UbbP0CG49 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UbbP0CG49 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UbbP0CG49 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UbbP0CG49 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UbbP0CG49 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UbbP0CG49 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UbbP0CG49 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms