Protein–RNA interactions for Protein: P0C7N9

Psmg4, Proteasome assembly chaperone 4, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmg4P0C7N9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmg4P0C7N9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Psmg4P0C7N9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmg4P0C7N9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmg4P0C7N9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmg4P0C7N9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmg4P0C7N9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psmg4P0C7N9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms